肺炎是由细菌、病或真菌引起的肺泡感染。它是全世界发病和亡的主要原因之一，造成临床和经济负担以及全球公共卫生问题。人类呼吸道的微生物生态系统(或微生物组)占据不同的生态位。
科学家对呼吸道微生物组很感兴趣，因为它通过刺激免疫系统和防止病原体感染来促进人类健康。巴斯德研究所和法国国家科学研究中心的科学家证明，微生物组组成、病原体负荷和临床干预措施会影响嗜肺团菌引起的细菌性肺炎的严重程度。
研究结果发表在《细胞报告医学》杂志上。
在这项研究中，巴斯德研究所 Carmen Buchrieser 领导的细胞内细菌生物学单位的科学家与里昂团菌国家参考中心主任 Sophie Jarraud 合作，分析了呼吸道微生物群的多样性和组成。细胞内细菌病原体嗜肺团菌引起的肺炎患者在整个住院期间都应避免感染细菌、古细菌、真菌和原生动物。
嗜肺团菌会导致一种被称为退伍人病的严重肺炎，这种肺炎可以通过吸入淋浴、热水浴缸或空调系统等人工水源中受污染的气溶胶而感染。团病的亡率从 5% 到 40% 不等，具体取决于临床情况和地区。危险因素包括年老、已有肺部疾病、吸和免疫抑制，大约三分之二的报告病例发生在男性。
欧盟团病确诊病例从2005年的4,693例增加到2021年的10,004例，增长了113%。这种急剧上升的原因之一可能是气候变化，水温升高以及洪水更加频繁和强烈，使得团菌能够更快地复制并进入人类环境。
科学家团队将高通量细菌、古菌和真菌标记基因测序与定量方法相结合，以描述患者在感染过程中以及医院相关干预措施(例如机械通气和呼吸机等)中呼吸道微生物群的发展情况。抗生素的管理)。
